电子琴的确可以以传统乐器为原型发出各种音色，并且好一些的琴可以对这些音色进行效果设定甚至编辑调整它的物理波形。电子琴发出的某种乐器的音色肯定是和原型乐器有不一样的。其实这一点本来没有一部分人说得那样严重。因为电子技术的发展，经过一代又一代的改良，已经使得好的电子琴的音色越来越接近于原型乐器，以至于99%、99.9%，99.99%……的人耳朵分辨不出到底是原型乐器来演奏还是电子琴。在这样的情况下，如果仅仅是依靠听觉，那么电子琴和传统乐器的不同只有那0.01%的人听得出来。这个问题就不用讨论了。谁在喝水的时候会在乎一杯水里有一滴橙汁呢?需要讨论的只是想出多少钱来置设备。
同样的乐器，不同的牌子，发出的声音也不是完全一样的。每种乐器的音色音质都在一个很小的范围内而绝对不是单一的。
电子琴是人工制造的。不过，现在被人们普遍认可的乐器之中，也没有哪个是天然而成并且被人们直接采集回来就用的，那样不能按人的希望发出乐音，也就几乎不能称为乐器。
心理因素占了很大一部分。人们不断地给自己心里暗示：这是电子琴弹出来的，所以就会总觉得不一样。很多的人也关心同一乐器中的声音的不同，不妨把它叫做音质。比如，钢琴在使劲敲击时和轻弹时，不仅仅是音量有变化，声波的形状也有变化。事实上，好的电子琴也会在采样时做出这种变化。它并非精确地一丝不差地做到和钢琴一样，但它可以创造出新的波形。
同样的，我们也可以知道，电子琴可以去近似传统乐器，但这远远不是电子琴的目的。我们还是只来拿音色说，高端的电子琴可以在钢琴和黑管之间做出不可计数的过渡。有的人说电子琴音色不纯(其实那99.99%的人说不纯并不重要)，是拿电子琴的音色去围绕原型乐器来比，在希望得到原型音色、以传统乐器为“纯”的基础上得到的结论。但是，电子合成音色、诱导音色、幻想音色、效果音色都是传统乐器没有的，没有了原型乐器，哪里还谈得上“纯不纯”这一概念?这些就是电子琴在音色上面自己的东西。
电子琴除了在音色上有自己的独特的地方之外，还有很多都是自己特有的。首先，自然界的声音的变化是连续地过渡的，在电子琴出现之间，传统的乐器是以一种离散地方式来表现音乐的，小号和长号之间基本上没有或有很少地过渡，当然这不是错误，但应当承认这的确存在一些局限性。钢琴的do就是do，re就是re，中间没有过渡。而现在电子琴打破这了种局限(有的乐器也在某些方面在电子琴之间就打破了局限或者根本没有这种局限)，从某种角度上来说回归了一种自然状态。
另外，电子琴是三维立体地表现音乐的乐器。咱们还是以音色为例，它是各种音乐的有机结合——不是“凑合”或者“简单叠加”，它是一种系统性的思维观念，它不仅仅是要近似所有乐器的音乐，它在系统的整体性、结构性、层次性和开放性上都有新的内涵。也就是说，整体大于部分之和。
