古琴琴谱现在存世共一百五十余部，历代重要的琴谱琴书如下：
汉代最重要的琴谱琴书：扬雄《琴清英》、诸葛亮的《琴经》。
现存的历史最早文字谱：唐初手抄卷子《碣石调幽兰》(现存日本东京国立博物馆);最早由五代十国丘明记谱。
碣石调幽兰
现存最早的琴谱。原件在日本。系唐代手抄卷，仍保持早期的文字谱记写方式，具有很高的史料价值。谱前解题说明此曲传自南朝梁代的丘明。曲名前冠以调名，为琴曲之仅见。据推断应该是用碣石调表现《幽兰》的内容。
最早的减字谱：宋代姜夔《白石道人歌曲》中的《古怨》;文字谱由唐朝曹柔简化为减字谱。
白石道人歌曲
词曲专集。宋代姜夔撰。内有琴歌《古怨》一首，旁缀减字谱，为现存最早的减字谱琴谱。
明代重要琴谱：《神奇秘谱》、《太音大全集》、《西麓堂琴统》、《太古遗音》、《风宣玄品》、《琴书大全》、《松弦馆琴谱》、《浙音释字琴谱》、《三教同声琴谱》。
神奇秘谱
琴谱。编者朱权。明洪熙乙巳年(1425)成书。现存最早的琴曲谱集。全书共三卷。上卷《太古神品》收十六曲，如《广陵散》《流水》《阳春》《酒狂》等，多为北宋以前的名曲，保留有早期传谱的原始风貌。中、下卷《霞外神品》收三十四曲，如《梅花三弄》《长清》《白雪》《大胡笳》《离骚》等，均属历史悠久的古代作品。还有南宋浙派名家的作品《潇湘水云》《樵歌》等。所有琴曲都有解题，提供了史料，为研究古代音乐作品的重要文献。
风宜玄品
明代琴谱。朱厚爝辑于嘉靖十八年。共十卷。首卷为指法、调式等文字六十二则，手势图一百五十四幅，文字多取自《太音大全集》。收曲一百零一首，包括三十二首琴歌。
浙音释字琴谱
明代琴谱。南昌龚经编释。成书于1491年前。原书残，现存三十九曲。每曲逐音配有文字，大多难以演唱。个别为传统琴歌，如八段的《阳关三叠》是现存最早的版本。
西麓堂琴统
明代琴谱。编者汪芝。成书于嘉靖乙酉年。共二十五卷。前五卷辑录南宋徐理的《琴统》和其他人的论文、咋说。后二十卷收录自宋代的琴曲一百七十曲，其中有《广陵散》的两种版本，以及外调琴曲一百多种等，多为其他谱集所未收。为明代收曲最多而且独具特点的谱集。
杏庄太音补遗
《杏庄太音补遗》《杏庄太音续谱》：编者萧鸾。《杏庄太音补遗》成书于嘉靖三十六年，共三卷，收七十二琴曲。编者强调本人是徐门正传，并在每曲前配以相应的“吟”，作为序曲。《杏庄太音续谱》成书于嘉靖三十九年。书中包括他游历吴、越所得的传谱和他自己创作的琴曲三十八首。
三教同声琴谱
明代琴谱。编者张德新。明万历壬辰年成书。收四曲，均有词。其中《释谈章》为首次刊传之佛教曲;另两首《明德引》《孔圣经》为儒教曲，还有一首《清净经》为道教曲。故名《三教同声琴谱》。
松弦馆琴谱
《松弦馆琴谱》：虞山派传谱。编者严征。成书于万历四十二年。初版收二十二曲，再版陆续增至二十九曲。书中有编者所撰《琴川谱汇序》，批判了当时在琴曲中滥填文字的风气。在琴届有较大的影响。
清代重要琴谱：《大还阁琴谱》、《松风阁琴谱》、《德音堂琴谱》、《诚一堂琴谱》、《五知斋琴谱》、《春草堂琴谱》、《自远堂琴谱》、《琴学入门》、《蕉庵琴谱》、《天闻阁琴谱》、《枯木禅琴谱》、《琴学丛书》、《琴学心声》。
琴学心声
清代琴谱。清康熙五十四年庄臻凤撰。共收十四曲，都是庄氏自己创作或改编的作品。其中八首有歌词，有些歌词是庄氏自制。
大还阁琴谱
一名《青山琴谱》。虞山派徐上瀛传谱。刊于康熙十二年。所收三十一首琴曲中，增加了《松弦馆琴谱》不予收录的《雉朝飞》《乌夜啼》《潇湘水云》等快速节奏的曲目。书中有编者所撰《万峰阁指法密笺》《溪山琴况》各一卷。
松风阁琴谱
清康熙十六年程雄选定。收十一曲，均注明来源。其中包括韩石耕等人的传谱。另附《抒怀操》一卷，收三十七曲。
五知斋琴谱
清周鲁封根据徐祺传谱编印于康熙六十年。共八卷。所收三十三曲多注明出处，指法细致详尽，在旁注中有徐氏加工发展之处及评语。后记也比较有特点，从中可以了解徐氏对作品的独到了解。为近代流传很广的琴谱。
自远堂琴谱
清广陵派琴家吴虹传谱。共十一卷，收九十三曲，末卷三十曲附有歌词。
琴学入门
张鹤撰。收琴曲二十首。附工尺谱。其中《阳关三叠》《渔樵问答》等曲至今仍流行。
蕉庵琴谱
清同治七年，广陵派琴家秦维瀚辑。收录三十二曲。《龙翔操》等曲至今流传。
枯木禅琴谱
清光绪十九年刊本，广陵派释空尘编。收三十二曲，多有解题或后记。
民国及现代：《梅庵琴谱》、《今虞琴刊》、《琴曲集成》、《古琴曲汇编》、《古琴曲集》。
梅庵琴谱
山东诸城王鲁宾传谱。由弟子徐卓、邵森编订，1931年初版。今版分三卷，上卷论琴的形制、声律、指法;中卷收十五曲，下卷为今译简谱。所收《长门怨》《关山月》《搔首问天》等曲为诸城派代表曲目。
